Указом Президента Российской Федерации от 25.03.2020 № 207 «О внесении изменений в Указ Президента Российской Федерации от 21.01.2020 № 21 «О структуре федеральных органов исполнительной власти» и в структуру федеральных органов исполнительной власти, утвержденную этим Указом» Росздравнадзор переведен в ведение Минздрава России.
Изменениями, внесенными в утвержденную Указом Президента РФ от 21 января 2020 года № 21 структуру федеральных органов исполнительной власти:
раздел II «Федеральные министерства, руководство деятельностью которых осуществляет Правительство Российской Федерации, федеральные службы и федеральные агентства, подведомственные этим федеральным министерствам» после слов «Министерство здравоохранения Российской Федерации» дополнен словами «Федеральная служба по надзору в сфере здравоохранения»;
из раздела III «Федеральные службы и федеральные агентства, руководство деятельностью которых осуществляет Правительство Российской Федерации» слова «Федеральная служба по надзору в сфере здравоохранения» исключены.