Родился 21 июня 1903 года в эстонском селе Эсто-Хагинское Медвеженского уезда Ставропольской губернии (теперь село Яшалта, административный центр Яшалтинского района Калмыкии) в крестьянской семье. Отец, А́брам Юриевич, в возрасте шестнадцати лет вместе со своим отцом, бобылём из баронского имения Вохнья (эст. Vohnja) Ракверского уезда Эстляндской губернии (теперь деревня Вохнья в волости Кадрина уезда Ляэне-Вирумаа в Эстонии), переселился в Сибирь. Мать, Мария Юриевна, была домохозяйкой.

Генерал-лейтенант, бывший командир 8-го Эстонского стрелкового корпуса

В Советской Армии с 1922 г. Окончил Военную академию им. М. В. Фрунзе и Академию Генерального штаба. В период Великой Отечественной войны - начальник штаба 2-го Особого стрелкового корпуса. Начальником штаба 50-й армии был до декабря 1941 г., затем начальником штаба 59-й армии, командиром 249-й и 7-й эстонских дивизий, 8-го эстонского корпуса.

8-й Эстонский стрелковый корпус, которым он командовал до окончания войны, находился в действующей армии в составе Калининского, Ленинградского и 2-го Прибалтийского фронтов в разное время 916 дней. В непосредственном соприкосновении с противником соединения и отдельные части корпуса за это время находились в течение 344 дней. Корпус вёл наступательные бои в течение 123 дней, из них в боях под Великими Луками — 37 дней, в боях за освобождение Эстонии — 69 дней и в боях в Курляндии — 17 дней.

15 сентября 1943 года Совнарком СССР присвоил Лембиту Пэрну звание генерал-лейтенанта.

Части и соединения корпуса участвовали в освобождении девяти городов: Великих Лук, Невеля, Новосокольников, Нарвы, Калласте, Муствеэ, Таллина, Хаапсалу, Курессааре, пяти портов: Рохукюла, Виртсу, Куйвасту, Роомасааре и Кихельконна. Всего корпусом освобождено до 4100 населенных пунктов.

После войны Пэрн министр обороны и военный комиссар Эстонской ССР.

Награды:

Орден Ленина (30 апреля 1947 года);
3 орденами Красного Знамени (Указами Президиума Верховного Совета СССР: от 31 августа 1941 года, за самоотверженный действия в ходе боев на рубеже реки Березина и при отходе за Днепр; от 3 ноября 1944 года, за умелое руководство в боях за остров Муху и Сааремаа; от 20 апреля 1953 года, за выслугу лет);
Орден Кутузова 1-й степени (Указом Президиума Верховного Совета СССР от 5 октября 1944 года, за умелое руководство войсками при освобождении материковой части Эстонии);
Орден Суворова 2-й степени;
Орден Красной Звезды;
«Знак Почета» (Постановлением Президиума ЦИК СССР от 16 августа 1936, за большой личный вклад в строительство Челябинского тракторного завода).
Медаль «XX лет Рабоче-Крестьянской Красной Армии».

Являлся почётным гражданином городов Таллина и Великие Луки (присвоено решением Великолкуского городского Совета депутатов от 8 мая 1965 года).